不孕癥的鑒別診斷主要是病因的鑒別。以下就部分病因進行描述：

1、子宮內(nèi)膜非典型增生

在不孕癥女性中多囊卵巢綜合征（PCOS）發(fā)病率很高，其中由于單一的雌激素作用，極易導(dǎo)致子宮內(nèi)膜增生過長，嚴重者可致子宮內(nèi)膜非典型增生，臨床表現(xiàn)多為不規(guī)則出血及超聲下子宮內(nèi)膜增厚，分段診斷性刮宮及病理檢查有助于診斷。

2、甲狀腺及腎上腺功能失調(diào)

二者均可影響排卵而引起不孕癥，通過臨床表現(xiàn)及內(nèi)分泌功能測定可除外相關(guān)疾病。

3、慢性消耗性疾病

慢性消耗性疾病可影響生殖功能，常見有腎病、系統(tǒng)性紅斑狼瘡、糖尿病等。